A terapia para o envenenamento por mercúrio deve ser direccionada para baixar a concentração do mercúrio no orgão afetado ou no sítio da lesão, como por exemplo, aquando a ingestão de mercúrio orgânico ou inorgânico, procede-se à sua descontaminação gastrointestinal para diminuir a sua absorção e os seus efeitos tóxicos.

​

Para os casos mais severos, nomeadamente com insuficiência renal aguda, a hemodiálise deverá ser o tratamento de primeira linha, em conjunto com a administração de agentes quelantes do mercúrio, como a cisteína, o EDTA, BAL ou a penicilamina. Devem-se tomar precauções para o uso indevido dos agentes quelantes em pacientes intoxicados com mercúrio.

​

A excreção biliar e a reabsorção pelo intestino podem ser interrompidas pela administração oral de uma tiol resina não absorvível, que se pode ligar ao mercúrio e favorecer a excreção fecal.